多元异常事务处理局主要分为多个部门，每个部门都有每个部门需要管理的事情，下面介绍每个部门的名称以及主要负责的职责。

情报部：负责收集各种跟异常相关的情报定将这些筛减可能不是一堂出现了情报，被确认为是异常出现的情报，和已经被记录在案的异常档案进行比对，确认该异常是否已经出现过，且记录过应对的方式，确认完成后，会将这些情报整理发送给行动部。

如果发现疑似是恐怖或以上等级的异常，需要快速查验该异常是否已经被记录在档案上？查验完成后以紧急任务的方式发出去，情报部，所使用的异常代号为不会坏的时钟，拥有异常特性为时钟所挂着房间的时间流速和时钟所显示的时间一致，且房间内的人不会受到任何影响，而外面依旧处于正常的时间流速。

研究部：主要负责研究以及解析各种已知或者未知异常的特性，以及这些特性如何正确的使用，以及如何规避异常的危害，研究部可以使用耗材，对异常进行各种实验研究，不过研究部每周只能使用十名耗材。

研究部所使用的异常代号为无门之钥，拥有着异常特性为，拿的钥匙想着自己要去的地方，然后用钥匙在任意的地方拧动，就会打开一扇门而门的另一边则是通向你要去的地方，不管你所在位置，距离你所要去的地方有多远，就算隔着一个宇宙，也能够打开你要去的地方的门。

管理部：主要负责管理处理局的各种事务，以及看管那些被收容的异常，还要负责各个部门的人员调配以及以及紧急任务的人员调动和装备安排。

管理部所使用的异常代号为传速旗，该异常拥有的特性为旗帜拿在手上或者放在车辆上，将速度达到旗帜你脑海中所想的地点。

行动部：主要负责收容处理各个宇宙出现的任何异常事件，通常情况下，行动部都是两人一组去收容或处理异常，如果遇到紧急任务时，一般是100至500人不等的队伍去处理紧急任务。

行动部所使用的异常代号为信息电网，该异常拥有的特性为可以将纸质文件电脑文件脑中所想的事情以信息的方式传播到所指定的。储存事物上，不管是纸质文件，电脑，手机还是大脑都行。

后勤部：主要处理各种异常所造成的影响和破坏，排异常所带来灾难后的幸存人员，天灾以下等级的异常事件的幸存人员需要进行记忆清除，以防止关于异常的信息传播出去。

（关于异常的信息传播，会导致该星球的异常出现的概率增加，而且就算后续进行处理，这种概率依旧不会下降，用记忆清除异常相关信息或者进行掩盖，可以有效的减缓异常出现的概率，当某个星球上出现天灾级异常，那么那颗星球上异常已经多到无法进行掩盖的地步，或者天灾级所造成的破坏和影响很难完全覆盖。

如果一个星球出现灭世级异常，先保住那些人，存有人性命再说，灭世级被处理后，这颗星球将会在千年内不会再出现任何异常。）

后勤部所使用的异常代号为古旧书架，该异常拥有的特性为书架上有许多的书，这些书都具有不同的作用，很多书都能够对于疏散人群或者预言后续的灾难有很大的帮助。

档案部：负责收纳管理整理。各种各样的记录异常的相关信息的档案，且将这些档案整理归纳放到档案柜中，以及记录每一个档案所在的位置好，随时配合情报部调用档案。

装备部：负责制造研发各种武器装备研发的材料，主要来源于特殊档案155，以及负责分发各种武器，以及在紧急任务时发放重火力以及大范围攻击性武器。

装备部所使用的异常代号为染血的武器箱，该异常拥有的特性为，任何人都可以进入武器箱中，拿出或近战或远程或者重火力或者大范围杀伤性的武器，这些武器都具有不同的效果，不过这些武器都能够对异常造成有效的伤害。